La búsqueda de un asesino metódico lleva a la UAC a Arizona para buscar un sudes cada vez más evolucionado, y el equipo especula que Hotch está en carrera para ser el nuevo jefe de la unidad, en el estreno de la novena temporada.

Mientras la UAC se centra en el sospechoso de los asesinatos rituales que han estado investigando en Arizona, una extraña conexión dentro de la familia del sospechoso podría llevarlos a atraparlo finalmente.

Cuando un francotirador ataca Dallas, la UAC investiga si el próximo aniversario del asesinato de Kennedy es un factor motivador o si algo más está impulsando al sudes.

La UAC conoce a su nuevo jefe de sección, Mateo Cruz, quien, sin saberlo, comparte una larga historia de trabajo con JJ. Cruz se une al equipo mientras recorren las calles de Baltimore en busca de un sospechoso que deja a sus víctimas sin poder comunicarse.

Mientras Hotch lucha por su vida debido a las complicaciones de su apuñalamiento a manos de George Foyet, alias "La Parca", experimenta visiones de su difunta esposa, Haley. Mientras tanto, la UAC busca a una adolescente desaparecida e investiga a su padre como sospechoso de su desaparición.

Cuando la UAC investiga a las víctimas de posibles asesinatos rituales en Utah, las pistas les llevan a creer que el sospechoso podría tener fascinación por los juicios de las brujas de Salem. Además, García se prepara para la celebración del Día de los Muertos en su apartamento.

Después de una serie de estrangulamientos en Boston, la UAC busca a un sudes al que le gusta guardar recuerdos de las víctimas, y el equipo se pregunta si un vínculo común con las víctimas podría llevarles al culpable. Mientras tanto, la UAC se reúne junto a Rossi cuando su bar favorito está a punto de cerrar.

Cuando unos adolescentes reportados como desaparecidos son sospechosos de una serie de asesinatos en masa en Chicago, la UAC investiga su paradero para encontrar un motivo para los crímenes. Además, Morgan tiene sentimientos contradictorios cuando su novia se toma su trabajo en el hospital tan en serio como él.

Cuando aparecen esqueletos en el patio trasero de una casa en Virginia, la UAC centra su investigación en la familia que vive allí, desenterrando secretos familiares arraigados en las pasadas divisiones raciales del Sur.

Cuando un joven desaparece de su casa en St. Louis, la UAC vuelve a investigar un caso similar para buscar al sospechoso.

Cuando la UAC es llamada a Kansas City para investigar una serie de asesinatos, se produce una tensa reunión entre Blake y su padre, un capitán de policía retirado, y su hermano, un detective, que deben trabajar juntos para ayudar a resolver el crimen.

Cuando la UAC va a San José a investigar una serie de asesinatos, García profundiza en su pasado de hacker y se reencuentra con su antiguo amor para ayudar al equipo en el caso.

Mientras que la UAC busca a un asesino justiciero que anda suelto en Cleveland, Rossi se preocupa cuando su exsargento de la Marina desaparece y va a Los Ángeles para encontrarlo. Además, el secreto que JJ ha estado ocultando al equipo puede estar alcanzándola.

Cuando JJ es secuestrado, la UAC profundiza en su tiempo en el Departamento de Estado para encontrar pistas sobre su desaparición y descubrir una misión secreta que pone su vida en peligro. Para ayudar en la búsqueda de JJ, el equipo pide a Prentiss que los ayude en la crisis, en el episodio 200.

Cuando la UAC investiga varios asesinatos en el área de Pittsburgh, el equipo busca un par de sudes trabajando en equipo. Además, García y Morgan comparten sus planes para el Día de San Valentín con sus respectivos seres queridos.

Cuando una niña de 4 años desaparece mientras está con un pariente en Mississippi, la UAC descubre algunas verdades sorprendentes mientras el equipo corre para encontrar a la niña y ponerla a salvo.

Misteriosas muertes por ahogamiento descubiertas en el desierto de Las Vegas hacen que la UAC intente averiguar la verdadera causa y motivo de los asesinatos.

Cuando se encuentran tres cuerpos con marcas de mordeduras de animales y humanos en una tumba poco profunda cerca de Milwaukee, la UAC tiene preguntas desconcertantes que responder. Mientras tanto, Reid y García se entrenan para un examen de aptitud física de la compañía, pero tratan de ocultar su preparación a Morgan.

Mientras la UAC termina una investigación sobre apuñalamientos inusuales en el norte del estado de Nueva York, la visita de Morgan a uno de los sobrevivientes del crimen podría generar más preguntas para que el equipo responda.

Cuando aparecen dos víctimas de asesinato en una comunidad de Virginia Occidental, la UAC descubre una larga disputa entre dos familias y debe investigar qué lado podría ser responsable de las muertes.

Una serie de secuestros selectivos cerca de Memphis hacen que la UAC busque una coincidencia entre las personas desaparecidas y un motivo que los lleve al sospechoso. Mientras tanto, Savannah expresa su frustración a Morgan por la cantidad de viajes que hace por su trabajo.

Cuando la UAC es convocada a Texas para consultar sobre asesinatos de prostitutas, las pruebas apuntan a asesinatos con connotaciones religiosas. Pero a medida que profundizan en la investigación, el equipo podría poner sus vidas en riesgo, en la primera parte de la novena temporada final.

La UAC continúa su investigación de asesinato en Texas, y las pistas descubren una profunda red de corrupción que podría ser el motivo de los asesinatos. Mientras tanto, cuando la vida de un miembro del equipo pende de un hilo, otro miembro preocupado de la UAC debe enfrentarse a un triste secreto del pasado, y García es empujada a la acción para salvar a un colega, en la conclusión de la segunda parte del final de la novena temporada.

Cuando aparecen víctimas muertas por envenenamiento con arsénico en Long Beach, California, las amenazas de muerte escritas a mano y otras pistas hacen que la UAC busque un sospechoso fascinado con la mitología griega. Mientras tanto, a Hotch le preocupa participar en el día de la carrera del tercer grado de Jack.