Una colisión con el Prisma Paradoja envía a Sonic a un mundo paralelo llamado Nueva Yugork, donde el opaco ambiente se ve extrañamente familiar.

Un apagón les da a dos rebeldes la oportunidad de irrumpir en un laboratorio donde el Consejo del Caos está estudiando la extraña conexión de Sonic con su fuente de energía.

Para proteger el fragmento de prisma, los rebeldes luchan contra el Consejo del Caos. Luego, Sonic hace un descubrimiento impactante sobre los eventos que destruyeron su mundo.

En una dimensión llamada Laberinto Boscage, Sonic encuentra versiones de sus amigos que viven en los árboles, quienes le advierten de un monstruo que habita en la jungla.

Para poder volver a la dimensión correcta, Sonic debe luchar contra el monstruo de la jungla que les declaró la guerra a sus amigos y capturar el poderoso fragmento de prisma.

De vuelta en Nueva Yugork, Sonic intenta convencer a Nueve de que se una a la Resistencia, pero Nueve está enfocado en construir un nuevo hogar.

En el tropical Ningún Lugar, Sonic conoce a una amistosa banda de piratas y su misterioso capitán, a quien le encantan las fiestas.

Mientras el equipo de Sonic se apresura para obtener el fragmento, se dan cuenta de que no son los únicos que lo están buscando. Solo hay una forma de ganar: ¡deben ir rápido!